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山羊MyoG基因启动子区序列分析与结构预测

畜牧兽医学报
Chinese Journal of Animal and Veterinary Sciences
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摘要:
【摘要】 为探明山羊MyoG基因的启动子序列与结构及转录调控机制,本研究设计了1对引物,采用PCR扩增、测序以及序列比对分析,从波尔山羊基因组中扩增出一段长度为969bp的山羊MyoG基因的5′侧翼序列,其GC含量为50.6%。经过生物信息学分析,确定了其转录起始位点及活性区域;发现在转录起始位点上游-24bp处存在1个TATA-box,另外还发现了1个GC-box、2个CAAT-box、2个E-box和1个富含A-T碱基的模体结构;该序列还包含HSF、ADR1和cap等转录因子结合位点。通过比对分析,所得山羊MyoG基因5′侧翼序列与牛、马鹿、人、小鼠和鸡同源序列的相似性在37.22%~96.85%之间,说明不同物种间该序列具有一定的保守性。本研究为进一步探讨山羊MyoG基因的表达和调控机制奠定了理论基础。
【关键词】 山羊; MyoG基因; 启动子区; 序列分析; 结构预测;
引言:

【引言】MyoG 基因是生肌调节因子MRFs家族的主要成员之一,该家族基因具有一个保守的碱性螺旋-环-螺旋结构(bHLH),其包括肌细胞生成素(MyoG)、生肌决定因子D(MyoD)、生肌因子5(Myf5)和生肌调节因子4(MRF4)4种转录调节因子,其中MyoG 基因调控中胚层细胞分化为成肌细胞,再由成肌细胞融合为肌纤维这一过程,在肌细胞分化过程中起着中心调节作用。启动子是位于结构基因5′端上游的一段核苷酸序列,是RNA 聚合酶识别并与模板DNA 特异性结合的部位,保证转录起始的精准性。真核生物许多基因的启动子序列中常含有TATA-box、GC-box和CAAT-box等调控元件,这些调控元件的存在与分布对基因的正常转录有着不可分割的调控作用。因此,深入细致地研究启动子,对于了解包括MyoG 基因在内的各种基因的结构及其表达调控等具有重要意义。目前,在部分动物上人们对MyoG 基因5′侧翼启动子区的序列结构、表达调控与动物的肌细胞生成机理等方面的研究已经有相关的报道,Malik等对鸡MyoG 基因5′端833bp长的侧翼序列进行了分析,认为其中131bp的DNA 片段是包括E-box和肌细胞增强因子2(MEF-2)的启动子,其启动子的结构、转录起始位点及转录调控特点与小鼠和人的非常相似。王珊和宋兴超等分别对牛和马鹿MyoG 基因启动子区序列进行了克隆并进行了相应的生物信息学分析。但迄今为止,无论是绵羊还是山羊MyoG 基因启动子区的研究还未见报道。为此,本研究通过PCR扩增及测序等技术,获得了山羊MyoG 基因的启动子区序列,并对该序列进行了生物信息学方面的分析,以期为山羊MyoG 基因的结构、表达调控及其突变位点与山羊产肉性状等方面的研究提供理论依据。

作者:
刘铮铸;巩元芳;张文香;付志新
作者单位:
河北科技师范学院动物科技学院; 中国环境管理干部学院; 河北科技师范学院欧美学院;

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