利用SNP标记进行北京地区中国荷斯坦牛亲子推断的研究

摘要：

【摘要】本研究旨在利用SNP标记对北京地区中国荷斯坦牛群进行亲子推断,并分析场、母牛出生年月、公牛家系对系谱错误率的影响,以期为指导奶牛育种和生产管理提供依据。共选取了255个最小等位基因频率大于0.45的高多态SNPs标记,利用似然法,采用Cervus3.0软件对北京地区84头荷斯坦公牛和1 927头母牛进行亲子推断研究。结果显示,试验群体平均系谱错误率为20.9%,不同的场、出生年份和月份的母牛的系谱错误率有显著差异(P<0.05),而各公牛家系间系谱错误率差异不显著(P>0.05)。结果说明,错误系谱的发生主要是由于牛场本身记录不完善造成的。在我国亟需建立利用遗传标记监测、校正系谱准确性的制度,采取措施提高系谱的准确性,加快我国荷斯坦牛遗传改良进程。
【关键词】中国荷斯坦牛；似然法；亲子推断； SNP；系谱错误；

引言：

【引言】系谱信息在奶牛育种中有着重要的作用。错误的系谱会大大降低遗传评定准确性，影响选种选配的效果，降低群体的遗传进展，给奶牛生产带来巨大的经济影响。然而，在实际养殖生产中，系谱记录错误是难免的，它受多种因素影响，如配种记录、产犊、记录、系谱录入及整理中的人为错误等等，尤其在饲养管理较粗放的散养式牧场，犊牛出生后很难确定父亲甚至双亲，往往会造成系谱错误。世界范围平均的奶牛系谱错误率约为１１％。汪湛等报道了天津部分奶牛场的系谱错误率为１１．８３％，初芹等利用微卫星标记对北京地区２１个场的系谱错误率进行检测，平均为１６．３％。

作者：

郭刚；周磊；刘林；李东

作者单位：

首农集团北京三元种业科技股份有限公司三元绿荷奶牛养殖中心；中国农业大学动物科技学院农业部动物遗传育种试验室；北京奶牛中心；